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基于省自然科学基金项目财务检查的结果,结合新的高校财务制度和会计制度,对我国高校科研项目间接成本的核算及补偿问题进行了研究。指出我国高校科研成本核算在管理制度、核算体系、财务管理系统及人员、预决算体系及配套、人力成本补偿等方面存在的欠缺,并从制定统一完整规范的科研成本核算规范体系,构建成本管理系统并配备相应人员,完善科研经费预决算体系、合理补偿人力成本等方面提出政策建议。