植物内生真菌与宿主植物互惠共生,可提高宿主植物的营养吸收、抗逆境能力以及刺激宿主植物活性物质的产生,是植物病害生物防治领域的重要研究内容之一。植物内生真菌种类繁多,通过ITS基因序列扩增和测序分析,结合传统的形态学鉴定方法,可快速、有效鉴定内生真菌。本文采用传统形态学方法结合rDNA-ITS序列分析,对我国重要药用植物罗汉果中的内生真菌进行鉴定,并研究其多样性,以期为后期探究内生真菌与罗汉果互作关系奠定基础。采用组织培养法分离内生真菌,从罗汉果健康植株中共分离得到150株内生真菌,包括罗汉果雌株中的内生真菌96株和罗汉果雄株中的内生真菌54株。其中,122株内生真菌经形态学结合rDNA-ITS序列分析鉴定为9个属,均归属为子囊菌门,包含座囊菌纲(Dothideomycetes)和子囊菌纲(Sordariomycetes)。其中座囊菌纲(Dothideomycetes)真菌包含3科、3属;子囊菌纲(Sordariomycetes)真菌包含6科、6属。优势属为刺盘孢属(Colletotrichum)和镰刀菌属(Fusarium)。罗汉果雌、雄植株不同组织中内生真菌的定殖率及分离率的变化规律均不相同,雌株中以根中内生真菌的定殖率和分离率最高,叶片中的最低;而在雄株中以叶片中的定殖率和分离率最高,根中的最低。另外,不同菌株在雌、雄两种植株的不同组织中的分布均不同,结合内生真菌群落组成的相似性比较结果,表明部分内生真菌对罗汉果雌株和雄株,以及同一植株中的不同组织均具有偏好性。不同组织中内生真菌的多样性指数在0.11-0.69的范围,其中雌株根部的内生真菌多样性指数最高。