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复方中药的作用机理和物质基础的研究，是当今生物医学领域里的一个重大科学难题，中医证的本质不明确是中药作用机理长期不能被阐明的重要原因。分子生物学理论技术的飞速发展为解决这一问题奠定了理论基础和技术保证。我们的理论研究和初步的实验研究结果表明“中医虚证的基本发病学机理是由于细胞因子网络紊乱的结果”。根据中医学“药证对应原理”和相关的现代医学理论知识，我们从理论上提出了“复方中药的作用机理是调节细胞因子网络的功能态平衡”的假说。