筛选并鉴定胃癌患者血清中可能存在的特异性蛋白标记物，为胃癌的早期诊断提供更为完善的血清蛋白质指纹图谱模型。
方法收集60例胃腺癌患者手术前后外周血标本。采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）技术对胃癌患者（术前组、术后组、转移组）及正常对照组血清之间进行对比检测，筛选出胃癌患者血清中存在的特异性蛋白质或含量与正常人有差异的蛋白质。使用凝胶电泳（TRICINE-SDS-PAGE）技术对这些差异性蛋白质进行分离与纯化。通过基质辅助激光解吸电离串联飞行时间质谱（MALDI-TOF/TOF）技术对分离纯化的蛋白质进行鉴定，最终确定胃癌患者血清中具有特异性的蛋白标记物。
结果胃癌术前组与正常组的质谱数据得到15个特异性m/z峰值（P < 0.01）；通过SVM算法筛选出Youden指数最高的组合模型，得到m/z峰位于6 449.1的蛋白标记物；该蛋白胃癌术前组表达水平明显高于正常组（2 299.3 ± 2 029.3比509.5±168.3，P < 0.01）。胃癌术后组与术前组的质谱数据经过处理和统计学分析后，得到P < 0.01的特异性m/z峰6个；参考Youden指数最高的组合模型，得到m/z峰位于6 449.2的蛋白质标记物；该蛋白在胃癌术前组表达水平明显高于术后组（1 247.9 ± 685.0比476.5 ± 157.8，P < 0.01）。胃癌术前组与转移组的质谱数据经过处理和统计学分析后，得到P < 0.01的特异性m/z峰12个；参考Youden指数最高的组合模型，得到蛋白质标记物m/z峰位于6 448.9；该蛋白在胃癌转移组的表达强度明显高于术前组（1 506.9 ± 1 036.5比649.7 ± 621.0，P < 0.01）。通过MALDI-TOF/TOF平台对样本分离纯化及酶解后所得到的肽段混合物进行检测，m/z峰位于6 449的蛋白质经过鉴定为载脂蛋白CⅢ（Apo CⅢ）。
结论m/z峰位于6 449的蛋白质经过鉴定为Apo CⅢ，考虑为胃癌的血清特异性蛋白标记物，可为胃癌的早期诊断提供更为完善的血清蛋白质指纹图谱模型。该蛋白质在胃癌中的表达程度与其肿瘤进展程度有关，为后期研究特异性蛋白标记物与胃癌发生发展存在的关系提供了新的思路。