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细菌对四环素类抗生素的耐药主要是获得了有关编码相关蛋白的四环素耐药基因，通过外输泵出机制、核糖体保护机制及产生灭活四环素的钝化酶机制等介导。四环素耐药基因常与质粒、转座子、接合转座子等可移动性遗传成分相连，在细菌的种间或属间转移，导致其在菌群中广泛分布。四环素可在转录或翻译水平对耐药基因的表达进行调节，使菌株对四环素类药物表现出不同程度的耐药。