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独立学院培养应用型本科人才的办学定位决定着理论教学方面的特定要求,而独立学院创办初期在专业课程结构、师资队伍构成、教学方法等方面表现出来的诸多矛盾和问题必须给予重视,并采取措施逐步解决,以利独立学院健康、持续发展。本文主要就独立学院理论教学中存在的一些较为突出的矛盾和问题进行分析并提出解决这些矛盾和问题的办法、思路。