补体蛋白C3c与抑制剂Compstatin的结合自由能计算

来源 :大连海洋大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:orientaladam
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采用分子动力学模拟取样,运用MM-PBSA方法计算了人类C3c-Compstatin复合物的结合自由能。通过能量分解方法探究了人类补体蛋白C3c上抑制剂结合域MG4-MG5(巨球蛋白区域)上的主要残基与配体Compstatin纤维蛋白之间的相互作用和识别。结果表明:C3c与补体抑制剂Compstatin的理论结合自由能(-8.06kcal/mol)与试验值(-6.72kcal/mol)吻合较好,分子内能总和(-177.24kcal/mol)对补体抵制剂的结合贡献最大,其次为真空静电作用能(-108.74k
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