【摘 要】
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目的 了解福建地区Salivirus病毒的全基因组特征并对其遗传背景进行分析.方法 对2018年福建省342份腹泻儿童粪便标本中检测到的1份Salivirus病毒阳性标本进行高通量测序,获得病毒全基因组序列FUAN-01.对FUAN-01全基因组核苷酸序列和VP1区的核苷酸及氨基酸进行遗传进化分析.结果 FUAN-01全长7907bp.全基因组与参考株的核苷酸同源性为81.86％～98.21％,与KT182636株的同源性最高,二者ORF区(开放阅读框)编码蛋白存在14个氨基酸位点的差异.VP1区与参考株
【机 构】
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福建省疾病预防控制中心福建省人兽共患病研究重点实验室,福州350001
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目的 了解福建地区Salivirus病毒的全基因组特征并对其遗传背景进行分析.方法 对2018年福建省342份腹泻儿童粪便标本中检测到的1份Salivirus病毒阳性标本进行高通量测序,获得病毒全基因组序列FUAN-01.对FUAN-01全基因组核苷酸序列和VP1区的核苷酸及氨基酸进行遗传进化分析.结果 FUAN-01全长7907bp.全基因组与参考株的核苷酸同源性为81.86％～98.21％,与KT182636株的同源性最高,二者ORF区(开放阅读框)编码蛋白存在14个氨基酸位点的差异.VP1区与参考株的核苷酸酸同源性为76.83％～97.81％,与KT182636株的同源性最高;氨基酸同源性为85.27％～99.22％,与KT182636株同源性最高.FUAN-01属于Salivirus A1(SAV-A1)基因型.结论 首次在福建地区腹泻儿童粪便中发现Salivirus.国内SAV-A1株或由同一来源传入,与欧洲来源的病毒可能存在流行病学关联.需建立可靠的筛查办法,进一步对福建地区Salivirus的病原学及流行病学情况展开研究.
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