讲究安全性
　　治疗乙肝用药首先要强调安全性，乙肝患者病情易变化，疗程漫长，单一用药难以达到治疗目的，现多采用联合治疗，用药安全是首要的。多年以前曾经使用的多种肝炎用药，后来被证实是不安全的，例如阿糖腺苷、膦甲酸等，它们都有可能引起肾损害。目前使用的干扰素、拉米夫定等，同样存在严重的安全隐患，如果使用不当、选择不当或擅自停药都可能导致病情加重。
　　中药也同样存在着不安全因素。有些中药和中药制剂被证实具有明显的肝损害作用，如中药苍耳子、贯众、雷公藤、天花粉等，中成药小柴胡汤、复方青黛丸等。因此，要避免滥用，对于民间验方、偏方一定要慎用，以防中毒。有药物过敏史或属过敏体质的患者，一旦出现药物性肝损害，一定要终止该药物使用，及时前往正规医院诊疗。
　　追求有效性
　　不少乙肝老药已逐渐被淘汰。目前作为治疗乙肝的主打药物——抗乙肝病毒药物，公认的只有干扰素、拉米夫定等几种，其他标榜具有抗乙肝病毒性质的药物，目前尚未得到一致认可。
　　提倡经济性
　　治疗乙肝花费大、药物贵是众所周知的，乙肝患者病情反复无常，常须长期用药，不少患者因病致贫。因此乙肝患者用药一定要精打细算，少花冤枉钱。例如具有保肝降酶功效的药物非常多，选择用药时，一定要考虑经济承受能力，选择价廉物美的药物，如甘利欣注射液。
　　许多新药远期疗效未定，加上价格十分昂贵，不宜作为一线药物推荐试用。
　　掌握适当性
　　适当的药物 根据疾病与患者机体条件，权衡多种因素利弊，选择同类药物中最为适当的药物。例如早期肝硬化患者，选择抗病毒联合抗肝纤维化药物同时使用，疗效最好。
　　适当的剂量 使用干扰素治疗乙肝非常普遍，但剂量的把握十分讲究。如果剂量太小，难以奏效;剂量太大，药物副作用过强，患者身体难以承受。
　　适当的时间 例如长效干扰素每周使用1次，可以確保一周内患者血液中药物浓度基本保持在有效范围内，给患者减少痛苦和麻烦。
　　适当的给药途径 必须综合考虑用药目的、药物性质、患者身体状况以及安全经济、简便等因素。口服给药既便利又经济，而且患者少受痛苦，相反静脉滴注不提倡轻易采用。
　　适当的患者 治疗乙肝强调个体化、因人施治的原则，譬如干扰素的治疗对象，一定要求病情处于转氨酶升高、乙肝病毒复制指标阳性的患者;重度或重型的乙肝患者不宜使用干扰素治疗。
　　适当的疗程 按照治疗学原则，规定药物治疗的周期。抗乙肝病毒治疗和抗肝纤维化治疗都是需要长期坚持不懈的，疗效明显时，不能擅自停药，必要时延长治疗，以获得稳定持久的疗效。例如用拉米夫定和干扰素治疗乙肝，疗程需要在1年以上。有些药物却不宜长期使用，要避免延长给药时间，减少蓄积中毒、病毒耐药性、药物依赖性等不良反应的出现。例如乙肝患者一旦感冒发热，消炎药物使用一定要采取“短平快”原则，做到病除药止。