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目的
寻找新的鉴别诊断MTB复合群(MTC)高特异度和敏感的核酸靶标。
方法利用简单序列重复区间(ISSR)分型技术平台筛选MTC的特征片段，克隆测序获得特征序列并进行序列同源性分析，以该序列为基础设计MTC特征引物，并对211株分枝杆菌菌株(其中MTC107株、非结核分枝杆菌104株)进行鉴别检测。利用分枝杆菌属特征序列16s rRNA和MTC特征序列IS6110的鉴别结果，对MTC特征引物检测结果进行评估。
结果通过ISSR分型获得588 bp的MTC特征片段，该序列为MTC菌株的特征序列，位于MTB标准株H37Rv基因组的315947～316534位，以该序列为基础设计MTC鉴别引物MTCF/R，16s rRNA基因在211株分枝杆菌菌株中的扩增结果均为阳性，IS6110序列在107株MTC菌株中扩增阳性率为99%(106/107)，在104株NTM菌株中阴性检出率为100%(104/104)，MTCF/R引物在MTC菌株中的扩增阳性率为100%(107/107)，在非结核分枝杆菌菌株中的阴性检出率为100%(104/104)。
结论通过ISSR分型技术筛选出的MTC特征序列可作为新的核酸扩增靶标用于MTC和非结核分枝杆菌的鉴别诊断。