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实施排污权交易制度，在理论和实践中首先要解决的一个关键问题是初始排污权的分配，而在实践中以初始排污权的免费分配更具有操作性。针对电力行业火电机组的特点，从节能环保的角度出发进行初始排污权的分配，构建了基于节能环保的初始排污权的免费分配模型，并采用改进的粒子群算法——粒子群协同优化算法对该模型进行优化计算。算例表明该分配模型有利于燃煤总量最小化，且能够发挥排污权交易市场的作用，达到控制区域排污总量的目的；同时粒子群协同算法比普通的粒子群算法具有更好的收敛结果。