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用离散增量结合支持向量机方法预测蛋白质亚细胞定位
用离散增量结合支持向量机方法预测蛋白质亚细胞定位
来源 :生物信息学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gg499586617
【摘 要】
:
对未知蛋白的功能注释是蛋白质组学的主要目标。一个关键的注释是蛋白质亚细胞定位的预测。本文应用离散增量结合支持向量机(ID_SVM)的方法,对阳性革兰氏细菌蛋白的5类亚细胞定
【作 者】
:
赵禹
赵巨东
姚龙
【机 构】
:
内蒙古工业大学理学院
【出 处】
:
生物信息学
【发表日期】
:
2010年3期
【关键词】
:
蛋白质亚细胞定位
离散增量
支持向量机
阳性革兰氏细菌
Subcellular Localization Increment of Diversity Supp
【基金项目】
:
内蒙古工业大学重点项目ZD200418
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对未知蛋白的功能注释是蛋白质组学的主要目标。一个关键的注释是蛋白质亚细胞定位的预测。本文应用离散增量结合支持向量机(ID_SVM)的方法,对阳性革兰氏细菌蛋白的5类亚细胞定位点进行预测。在独立检验下,其总体预测成功率为89.66%。结果发现ID_SVM算法对预测的成功率有很大改进。
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