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南方菜豆花叶病毒(Southem bean mosaic virus,SBMV)是我国二类检疫性有害生物,以南方菜豆花叶病毒日本分离物(SBMV-J)总RNA为模板,采用RT-PCR方法扩增病毒外壳蛋白基因及其上游基因的cDNA片断并将其克隆到pMD18.T载体上。序列分析结果表明:SBMV-J cp基因由801个核苷酸组成,编码266个氨基酸,SBMV.J与其它分离物及株系印基因的核苷酸序列同源性为83%-97%,氨基酸序列同源性为86%-97%。由于SBMV各分离物及株系印基因的同源性较低,难于设计出