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为探明小麦条锈菌滇黔群体菌源关系，利用扩增片段长度多态性标记对云南、贵州具有不同 ＡＦＬＰ基因型的 ７１个小麦条锈菌分离物 （云南 ３９个，贵州 ３２个）进行了遗传结构分析。结果表明：小麦条锈菌云南和贵州群体共享 ＡＦＬＰ基因型达 ３２３％；ＡＭＯＶＡ分析显示：小麦条锈菌云南和贵州群体间的遗传变异仅占总变异的 ７％；最大简约树枝长评估揭示小麦条锈菌滇黔群体自由重组的可能性较低。因此，小麦条锈菌滇黔群体间重组几率较低而菌源交流较顺畅。