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本研究利用两份栽培稻（Oryzasativa L．）种质H1TAR005和IRGC20509杂交建立了含有500个单株的F2群体，采用内含子长度多态性标记对F2群体中的117株进行了标记基因型分析。研究发现一个内含子长度多态性标记，R101594，其标记座位上与父本（IRGC20509）相同基因型的纯合植株完全消失，且母本纯合基因型植株与杂合基因型植株的比率符合1：1（x^2c=0．90，x^2c〈X^2 0.05），表现出一种明显的偏分离现象。分析该分子标记所在的目的序列，R101954标记所位于的基因