癌症相关基因选择性剪接进化数据库的构建

来源 :复旦学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:zexuan123
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
选择性剪接是真核生物基因调控的基本调节机制之一,与各种类型的生理和病理活动相关.癌症相关基因的不正常剪接可能与多种癌症的发生发展有关.作为选择性剪接进化的主体,选择性剪接外显子展示了其在不同物种中多样的进化功能.本文系统整理了2 989个癌症相关基因的各项功能,通过比较基因组学的分析方法总结了癌症相关基因的选择性剪接外显子的功能和进化关系,建立了癌症相关基因选择性剪接进化数据库(ASeeDB 数据库).ASeeDB包含癌症相关基因外显子区域的进化保守性、结构域预测、Ka/Ks值、以及基因、转录本、外显子区域3个层次的表达量统计等信息,结合这些信息用户可以方便的检索有研究意义的基因或者外显子.外显子区域蛋白质结构域的预测可以帮助了解其可能的功能,而外显子是否存在选择性剪接又可以推及包含该外显子的转录本是否具有相似的功能以及推测剪接是否会对蛋白质功能发生影响.数据库提供的物种间的序列比对可以帮助用户发现没有注释的外显子区域或者是保留的失去功能的外显子.相比于基因层面的Ka/Ks,数据库提供的外显子层面的Ka/Ks对于发现适应性进化事件具有更高的敏感性,可以更加方便地预示基因中未知功能的区域.
其他文献
在羊养殖的过程中,各种常见的疫病不仅仅容易影响到羊的正常生长发育,同时还会影响到经济效益的实现.因此,如何切实做好羊病的临床诊断,进而进行科学防治尤为关键.大量的养殖
国际社会普遍力求在贸易自由和环境保护之间寻求平衡,在这种背景下,绿色贸易壁垒作为环境问题在国际贸易领域内的一种反映,目前已经成为国际盛行的贸易措施之一,也是WTO谈判的热
在所有者与经营者分离的现代公司中,股东并不直接经营或控制公司,行使公司经营职权的是董事会,其行为对股东和公司的合法权益有着直接而重要的影响。为保护股东和公司利益,各国立
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。 Please download to view, this article does not support online access to view profile.
期刊
方正大厦地处中国“硅谷”中关村核心地带,紧邻北京大学,是北大方正集团新的总部所在地.建筑师力图通过现代建筑语言诠释企业文化形象并传承本地区的校园文脉.
进入新世纪新阶段,随着我国对外开放水平的进一步提高和国际地位的不断提升,我国面临的国际局势发生了新的深刻变化,按照《中共中央关于加强党的执政能力建设的决定》的要求——
小学英语高效课堂的建设,需要教师的耐心和爱岗敬业的责任心,更需要教师具备扎实的英语基本素质和基础,同时在培养自身品德方面也应该具有很高的领悟能力。在全球化日益发展
温州匠人瓯塑师人物名片张红姬浙江省工艺美术大师浙江传统塑艺陶艺十大名师551人才工程培养人才温州市首席技师十路英才最美温州女性我与她实在是太熟悉了,要写点她什么,反
教学建筑的形态和发展取决于教育模式的选择和建筑本身的发展,本文通过对教学建筑的设计实践总结来探讨教学建筑中内在的逻辑和发展规律。
所谓执政模式,简单地说,就是执政方式的固化,是政党控制公共权力的体制、机制、途径、手段和方法取得比较稳定的形式,或者说,执政模式就是具有了一定稳定性和制度化特征的执政方式