长春地区幽门螺杆菌cagA基因及EPIYA基序多态性分析

来源 :中华微生物学和免疫学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mingxingc
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目的

研究长春地区就医人群中幽门螺杆菌(Helicobacter pyloriHp)毒力基因cagA携带率及其3′端编码CagA蛋白EPIYA基序多态性,并探讨其结构特征的差异与疾病的关系。

方法

PCR法扩增临床分离株HpcagA基因并测序,DNAMAN软件将测序后的核苷酸序列翻译成氨基酸序列,然后利用软件MEGA6.0对测序HpcagA基因碱基和蛋白质氨基酸序列进行多重对比分析和构建系统发育进化树。

结果

收集298例胃黏膜标本,共分离60株Hp菌株。Hp检出率与性别和年龄无关(P>0.05),消化性溃疡(PUD)组的Hp分离率高于非溃疡性消化不良(NUD)组(P<0.05)。cagA基因阳性率为90%(54/60)。其中成功测序的26株中,23株为东亚型,占88.4%;3株为西方型,占11.6%。东亚型菌株中22株为EPIYA-ABD,1株为EPIYA-ABBD;西方型菌株中,2株为EPIYA-ABC,1株为EPIYA-BC。经构建进化树发现,序列聚类为东亚型群和西方型群两大类,在东亚型群中疾病分布并没有出现明显聚集,西方型群均来自PUD组。4株来自PUD组的Hp发生了氨基酸突变且均发生在EPIYA-B这个片段。

结论

本地区分离的Hp cagA基因阳性率为90%,分布与胃肠疾病类型无关;EPIYA分型以毒力强的东亚型EPIYA-ABD型为主(84.6%,22/26)。EPIYA-B片段氨基酸突变与消化性溃疡密切相关;cagA 3′端DNA序列变化不大,没有明显的地区聚集性。

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