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[学位论文] 作者:魏雅卓, 来源:东北师范大学 年份:2008
作为一种重要的转录调控元件,转录因子结合位点的识别已经成为当前的研究热点。准确的预测、识别算法有助于人们识别不同转录因子的目标基因,进而研究转录因子结合位点在上游...
[期刊论文] 作者:郭洪波,魏雅卓,陆林英,马志强, 来源:信息技术 年份:2007
为有效管理已有组件,设计了一个组件管理系统。并通过Web Services技术将该组件库中的组件所提供的功能以服务的形式在Internet上发布,以解决异构分布式组件的互操作问题。...
[期刊论文] 作者:马志强, 崔颖, 马雅楠, 陆林英, 魏雅卓, 孙平平,, 来源:生物信息学 年份:2008
随着后基因组时代的到来,非编码区的研究已经成为科学家面临的挑战,对基因非编码区的一个主要研究方向就是对调控元件的研究。识别转录调控元件是理解基因转录机制和表达模式的......
[期刊论文] 作者:马雅楠,孙平平,魏雅卓,陆林英,崔颖,马志强, 来源:生物信息学 年份:2009
系统发育谱方法是目前研究较多的一种基于非同源性的生物大分子功能注释方法。针对现有算法存在的一些缺陷,从两个方面对该方法做了改进:一是构造基于权重的系统发育谱;二是采用......
[期刊论文] 作者:马志强,魏雅卓,崔颖,马雅楠,孙平平,陆林英, 来源:生物信息学 年份:2009
遗传算法是模拟生物进化过程的计算模型,是一种全局优化搜索算法。将遗传算法与转录因子结合位点识别问题相结合的新方法,以一致性序列模型作为保守motif的描述模型,通过对motif......
[期刊论文] 作者:陆林英,魏雅卓,崔颖,孙平平,马雅楠,马志强, 来源:生物信息学 年份:2009
支持向量机(SVM)是广泛应用于各个领域的分类算法,包括生物信息学。本研究应用SVM作为蛋白质相互作用的分类算法,所用蛋白质相互作用数据下载于墨尼黑生物信息学中心的酿酒酵母数......
[期刊论文] 作者:马志强, 孙平平, 马雅楠, 魏雅卓, 陆林英, 崔颖, 周, 来源:生物信息学 年份:2008
简要介绍了系统发育谱法的原理,着重阐述了K-mean聚类算法在对基因系统发育谱分析中的改进,并与传统的K-mean聚类算法进行比较。实验结果表明,改进的K-mean聚类算法在运用系...
[期刊论文] 作者:马志强,马雅楠,孙平平,魏雅卓,陆林英,崔颖,周春光,, 来源:生物信息学 年份:2008
系统发育谱算法作为一种有效的大规模基因组功能注释方法,已经被成功的应用到原核生物基因组的功能注释中去。通过对系统发育谱方法中的一个关键环节——相似谱的聚类进行分析,提出了一种基于统计建模的方法来对相似的系统发育谱进行聚类。实验表明,该方法在保......
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