后基因组时代，基因序列已经被破译，但生物功能的奥秘还没有解开。随着生物实验技术的快速发展，产生了大量的蛋白质交互网络数据，它蕴含......

蛋白质作为生命活动的体现者并非孤立存在，而是通过相互的交互作用完成细胞中的大部分过程。蛋白质交互（Protein-Protein Interactio......

蛋白质交互(Protein-Protein Interaction,PPI)网络是生物体内蛋白质之间相互作用形成的网络,在拓扑结构上呈现小世界特性和无尺度......

现实世界中的许多复杂系统都可以抽象地表现为网络形态,随着大型网络数据可用性的提高,以及学者们对复杂网络定量、定性特征研究的......

重叠社区结构普遍存在于社交网络、信息网络、技术网络和生物网络中,并蕴涵着有意义的信息,随着社区网络结构的日益复杂,网络中潜......

在计算生物信息学领域,重要蛋白作为生物存活和功能正常所必需的蛋白,在药物靶标定位、致病基因查找和合成生物学等方面有着非常广......

当前可用的生物数据在不断地迅速增长,仍有很多生物信息如蛋白质交互信息(protein-protein interac-tion,PPI)还未被发现,而这些潜......

生物网络的模块化是生物系统鲁棒性的一个基本前提。首先根据已有的算法分析改进了经典的谱方法，提出了一个提高模块化方法分辨率的......

蛋白质交互网络预测是后基因组时代生物学中很重要的研究内容。到目前为止,对蛋白质交互网络相互作用的预测都是假设相互作用是确......

为了探测一组连接紧密的功能模块以便为蛋白质的功能预测提供许多有用的信息,提出了一种基于蛋白质相似度的图划分聚类算法,基于节......

蛋白质相互作用关系预测是当前生物信息学研究的一个重大挑战.现有挖掘蛋白质相互作用关系方法大部分都是基于单种生物数据,这会影......

采用较大相关种子簇方法优化种子选择,获得更佳的起始聚类,在种子生长过程中忽略蛋白质交互网络（PPI网络）中关联较小的边,筛选掉基因......

进入21世纪,随着各类生物测序技术的发展,产生了越来越多的生物学数据,包括基因组数据、转录组数据和蛋白组数据等。借助机器学习......

针对在交互网络上的关键蛋白质识别通常只关注节点在拓扑层面上的一些特性，但关键蛋白质识别过程中有必要结合蛋白质功能方面的信息......

首先寻找蛋白质交互网络中的社区结构,得到基于节点度的局部路径相似度,然后预测蛋白质之间的链接。在蛋白质交互网络数据集上,与......

随着现代生物学的发展,从生物分子层面上研究生物问题对发现生命现象的本质尤其是理解疾病的致病原理的重要作用已经得到了广泛认......