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基于分子动力学模拟软件GROMACS设计了微生物谷氨酰胺转胺酶在不同温度水环境下的分子动力学模拟实验,通过计算模拟过程中酶蛋白主......
GROM ACS是应用广泛的开源分子动力学模拟软件,当前主要通过CUDA使用NVIDIA GPU进行加速计算.ROCm是一个开源的高性能异构计算平台......
分子动力学模拟可以通过多款软件进行﹐根据需要不同可以选择不同的软件﹐但GROMACS是应用比较广泛的。生物大分子的结构动力学决定其......
分子动力学模拟(MD)是一套通过计算机模拟生物体系内分子、原子运动的多体模拟方法.GROMACS是著名的MD应用,能够快速模拟生物及非......
A molecular dynamics study to investigate the cavity control of Prefoldin based bio nano actuator is presented in this p......
以计算机模拟真实环境,根据分子动力学模拟原理以及相关应用,提出了使用分子优化软件,将分割后的分子片段在ATB网站上进行最终优化......
GROMACS是著名分子动力学模拟软件之一,GPGPU技术能够使用图形处理器完成通用计算,是高性能计算的最新发展趋势.本文通过对Nvidia ......
GPU最初是专为图形渲染而设计的,近年来已经演化为高并行度、多线程、具有强大计算能力和极高存储器带宽的通用多核处理器,目前主......
分子动力学模拟(Molecular Dynamics,MD)是计算化学和生物模拟领域一种重要的计算手段,由于计算强度大,目前MD可模拟的时空尺度还......
在分子动力学并行计算的过程中,正确地处理好并行规模与PME(Particle-Mesh Ewald)方法的任务分配,对于提高分子动力学的并行效率具......
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逆蒙特卡罗方法(Reverse Monte Carlo method),是以部分确定的物理规律为约束条件,根据实验数据多次模拟,用以解释实验现象和发现......
本文以计算机模拟真实环境,根据分子动力学模拟原理以及相关应用,提出了使用分子优化软件,将分割后的分子片段在ATB网站上进行最终......
GROMACS是一款被广泛采用的分子动力学模拟软件。本文从扩展力场出发,使之适用于粗粒化系统的模拟,从而能使用GROMACS标准工具生成......
在物理学上，人们把物质分为三态，即固态、液态和气态。液晶是介于液态和固态之间的一种独立的物质形态，它既具有液体的流动性，又具有晶......
分子动力学模拟是对微观分子原子体系在时间与空间上的运动模拟,是从微观本质上认识体系宏观性质的有力方法.针对如何提升分子动力......
