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利用PCR-RFLP、Forced-PCR*RFLP、DNA测序法研究中国西农萨能奶山羊(Sa)、关中奶山羊(Gz)和内蒙古白绒山羊(IMWC)3个品种LHX3基因的分子遗传特性。结果表明，在第2内含子452 nt处存在T＞C的突变，第6外显子352 nt处存在T＞C的突变。在HinfⅠ位点，GZ、Sa和IMWC的等位基因T/C频率分别为0.492 9/0.507 1，0.376 3/0.623 7，0.698 4/0.301 6;在Msp Ⅰ位点，GZ、Sa和IMWC的等位基因T/C频率分别为0.492 9/0.507 1，0.633 8/0.366 2，0.267 2/0.732 8;以上位点在不同品种中的多态信息含量(PIC)在0.314 9～0.374 9之间。独立χ2分析表明，HinfⅠ和Msp Ⅰ位点的基因型频率分布在不同山羊品种间均存在极显著差异，暗示品种因素对这些基因型的分布具有显著影响。