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针对发生形变的医学图像的配准问题，提出了一种结合尺度不变特征变换(SIFT) 和边缘点集匹配的方法。对于参考图像和待配准图像，先通过SIFT 算法得到两幅图像的匹配特征点对，估算出待配准图像到参考图像的变换参数并进行变换，得到初步配准的图像；再提取初步配准图像和参考图像的边缘点，采用连贯点漂移 (CPD)算法来进行两个边缘点集的匹配，得到精确配准的图像。实验结果表明，该方法能够实现复杂形变下医学图像的配准，有望用于医学图像融合等技术中。