【摘 要】
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为了探讨尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)新吉富品系、萨罗罗非鱼(Sarotherodon melanotheron)及其杂交子代(Oreochromis niloticus♀×Sarotherodon melanotheron♂)IGF-I基因结构差异,研究IGF-I 基因与三种罗非鱼耐盐性能差异之间的的关系,通过快速扩增3、cDNA末端的方法,从鳃的总RNA,逆转录得到c
【机 构】
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上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室,上海201306
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为了探讨尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)新吉富品系、萨罗罗非鱼(Sarotherodon melanotheron)及其杂交子代(Oreochromis niloticus♀×Sarotherodon melanotheron♂)IGF-I基因结构差异,研究IGF-I 基因与三种罗非鱼耐盐性能差异之间的的关系,通过快速扩增3、cDNA末端的方法,从鳃的总RNA,逆转录得到cDNA,扩增,分别获得三种遗传型罗非鱼的3cDNA末端序列；A/T克隆测序后经BLASTX比对分析表明,所得到的序列是为胰岛素样生长因子-Ib基因(IGF-Ib).主要分析结果：①三种罗非鱼的IGF-Ib3端cDNA全长分别1076bp、1075bp和1079bp,包含完整的开放阅读框(ORF)546bp、一个终止密码及含polyA信号的3UTR；ORF编码182个氨基酸,包括信号肽(44aa),成熟肽B区(29aa)、C区(10aa)、A区(21aa)、D区(8aa)及编码70aa的E区；经PredictProtein网站在线分析,预测氨基酸二级结构为混合类型.②CluastalX2.0分析结果表明,三种罗非鱼的IGF-Ib氨基酸序列与其他脊椎动物的同源相似度达到75.8％～100％,成熟肽B、A区高度保守,C区第82位后缺失2aa,E区第131位和159位分别缺失3aa和1aa.③新吉富尼罗罗非鱼和杂交子代之间氨基酸序列没有差异,萨罗罗非鱼在E133位发生Ala/Pro氨基酸残基替换,从而与另外两种耐盐性强的罗非鱼一致,推测这些差异与三种罗非鱼耐盐性能有关.
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