氨基酸位点共进化分析方法及研究实例

来源 :世界中医药学会联合会中药鉴定专业委员会第二届学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户：gcwx258

【摘要】

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【作者】

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森林魏蒙张林碧

【机构】

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湖北中医药大学,中药资源与中药复方教育部重点实验室,湖北武汉430065;湖北中医药大学,药学院,湖北武汉430065

【出处】

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世界中医药学会联合会中药鉴定专业委员会第二届学术年会

【发表日期】

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2015年6期

【关键词】

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蛋白质氨基酸位点共进化生物功能

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共进化位点指蛋白质序列发生变异时,在氨基酸替换上存在相互关联的位点.在蛋白质中,如果不同位点间有结构/功能联系,那么其中一个位点的变异会使得对应位点上有极大几率出现氨基酸残基的补偿突变.自然选择论和近中性选择学说对这种突变发生的机制有不同的解释.无论它们发生的主导机制是什么,共进化位点的补偿突变为理解蛋白质结构与功能提供了重要思路.共进化位点的识别能在蛋白质功能和进化研究等多个方面发挥突出作用.近来,分析共进化位点的方法主要有"相关性系数法"、"微扰理论法"、以及"参数检验法"等.介绍了不同鉴定共进化位点的方法及其在不同领域中的应用,同时介绍了该研究所面临的问题,并对将来的发展趋势给出展望,以期为相关领域的研究者提供参考.

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