吉林骨髓库造血干细胞捐献者HLA-A、B、DR基因分布和单倍型分析

来源 :中华骨髓库第二届年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qq02040610
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  目的:了解中国造血干细胞捐献者资料库吉林分库HLA基因及单倍型分布特征.方法:采用PCR-SSP、PCR-SSO、PCR-SBT对吉林分库内10120名吉林籍捐献者HLA-A、B、DRB1基因低分辨分型,用Excel软件计算HLA基因频率、单倍型频率及其连锁不平衡参数.结果:在吉林分库内,HLA-A、B、DRB1基因(含血清学特异性)分别有21、45、13种,频率高的基因是:A*02,A*24,A*11,A*30; B*13、B*40 (61)、B*51; DRB*15,DRB*09、DRB*07、DRB*12.在HLA单倍型分布中,两座位连锁频率较高的有:A30-B13、A2-B46、A2-B61、A2-B58;B13-DR7、B13-DR12、B46-DR9、B61-DR9; A2-DR9、A30-DR7、A2-DR12、A2-DR 15;三座位连锁频率较高的是:A30-B 13-DR7、A2-B46-DR9、A2-B13-DR12、A2-B61-DR9.结论:此研究有助于为临床移植寻找合适匹配的供受对,并为吉林地区健康人群HLA基因多态性以及HLA相关疾病的研究提供有意义的参照数据.
其他文献
目的:识别确认中国汉族人群中的HLA新等位基因.方法:采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(polymerase chain reaction-sequence specific oligonucleotide probes,PCR-SSOP)方法、聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-sequence specific primer,PCR-SSP)方法以及基因测序分型(sequence-b
目的:筛选适合于解决中国南方汉族人群HLA-SBT模棱两可分型结果的杂合性模棱两可引物分离法(HARPs)引物并评估其解决能力和应用价值.方法:采用HARPs引物对132个HLA-A、131个HLA-B和89个HLA-DRB1基因测序分型中的模棱两可标本进行测序分型.结果:86.27%的HLA-A、73.86%的HLA-B和38.11%的HLA-DRB1基因模棱两可分型结果可以通过HARPs方法有
目的:了解岳阳市造血干细胞捐献者人类白细胞抗原HLA-A、B、DRB1位点等位基因多态性.方法:对岳阳市HLA配型实验室接收的造血干细胞捐献者HLA分型标本采用PCR-SSP及PCR-SSO方法实施HLA分型,从已完成的合格的分型结果中挑选岳阳籍的捐献者的分型结果21152份,计算HLA-A、B、DRB1等位基因的频率.结果:在岳阳市组织配型实验室的分型数据内,HLA-A位点等位基因(含血清学特异
目的:中华骨髓库自从2001年重新启动以来已成为亚洲最有价值的骨髓库,为拯救患者的生命发挥了积极的作用.但分型成本高和样品量大成为影响骨髓库快速发展的两大难题.需要找到一种低成本高通量检测手段解决骨髓库所面临的问题.方法:博奥生物公司独创性建立了基于SSOP原理的正向杂交HLA基因分型芯片技术体系,使HLA分型检测真正实现了低成本高通量检测.结果:截至到2007年底共完成4万多份中华骨髓库样品检测
目的:研究四川骨髓库中四川籍汉族人群HLA-DRB1*14等位基因分布.方法:在四川骨髓库8934名四川汉族造血干细胞捐献志愿者中随机筛选107例中低分辨为DRB1*14的样本,以PCR-SBT分型技术检测DRB1位点的第二外显子以鉴定HLA-DRB1*14等位基因.结果:共检出6种DRB1*14等位基因,包括DRB1*140101/1454(56.0%),DRB1*1403(1.8%),DRB1
目的:研究一例新的等位基因HLA-B*5413的发现和确认.方法:应用PCR-SSP技术进行HLA分型检测;PCR-SS0技术进行HLA分型复核;DNA测序技术进行新等位基因的核苷酸序列测定,在NCBI和EBI基因数据库上进行基因序列比对分析验证,最后提交.结果 新等位基因与所有已知的HLA-B座位的等位基因的序列均不相同,与同源性最高的HLA-B*5401相比,在第二外显子上有6个核苷酸差异:第
PCR-SSP技术(PCR一序列特异性引物)这是一项针对ABO基因突变位点的不同核昔酸分别设计一系列特异性引物,直接扩增ABO等位基因片段的检测技术。这种方法简单、易操作、结果直观。血清学检测技术简单快速,但有局限性,受生理、病理等因素的影响可导致正反定型不符,而ABO血型基因的检测可解决上述问题。笔者采用PCR-SSP技术对32例正反定型不符的临床患者标本作ABO基因分型。
目的:采用聚合酶链反应-序列分析基础上的HLA分型(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT)方法,研究中国造血干细胞捐献者资料库(以下简称为中华骨髓库,CMDP)四川分库中四川籍汉族人群HLA-B*15组等位基因的分布特点.方法:从四川骨髓分库中汉族人群中/低分辨分型HLA-B*15阳性样本中按不同血清学特异性分层抽取107例
目的:调查3例带有HLA-DR*0114新基因的家系遗传状况.方法:HLA低分辨分型采用PCR-SSO流式分型技术,DNA测序采用等位基因特异性技术.结果:新基因HLA-DR*0114序列与DRB1*010101相比,第2外显子区域有3个碱基发生突变,造成2个氨基酸发生改变.257位碱基A>C, 导致86编码子的氨基酸由天冬氨酸(Asp)变成丙氨酸(Ala).265位碱基T>C,89编码子的氨基
满族分布在全国各地,吉林省是满族聚集地之一,吉林骨髓库中已经积累了很多满族造血干细胞捐献者的分型数据,分析这些数据将有助于帮助估算为需要移植的患者在骨髓库中找到HLA匹配供者,了解吉林地区满族人群的遗传特征。本文对吉林省满族造血干细胞捐献者作了HLA-A, B,DR低分辨基因分型和统计分析。