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由于特定条件的限制，机载计算机箱体散热器的设计需要考虑导热性和尺寸双重要求。提出一种改进的基于遗传算法的箱体散热器结构选择算法，算法采用二进制编码，每个染色体表征箱体尺寸、肋片个数与肋厚，为获取最优的设计方案，以散热板体积和热阻为优化目标构造目标函数；求解过程中，在每一代种群中计算出与每个染色体相对应的体积、热阻指标及目标非标准化对决策的影响度，进而利用影响度因子确定群体中每个染色体对最小体积、最小热阻的相对优属度，再利用相对优属度构造相对适应度函数，并求取相应的适应度函数值，减小了目标非标准化对优化结果的影响。给出了应用该算法处理某箱体散热器实例，结果表明该算法的可行性与有效性。