日本囊对虾α-淀粉酶基因SNP位点的检测与分析

来源 :第八届世界华人虾蟹养殖学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaofch22
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  α-淀粉酶基因在对虾的营养吸收和代谢调控中具有重要作用,是对虾生长相关的候选基因之一。本研究采用克隆和PCR技术获得日本囊对虾α-淀粉酶基因3099bp的编码区全序列,包括10个外显子和9个内含子。该基因开放阅读框长1539bp,编码512个氨基酸,由信号肽(17个氨基酸)、21个活性位点残基,2个钙离子结合位点残基和10个半胱氨酸残基构成,主要包括A、C功能域。本研究针对A功能域,选取包含第6、7、8外显子和第6、7内含子共891bp的序列片段为研究对象,采用PCR产物直接测序法对本实验室构建野生日本囊对虾群体43个个体进行SNPs的初步检测,共发现24个SNPs,其中2个SNPs是外显子区域的错义突变,7个SNPs是外显子区域的同义突变,15个SNPs是内含子中的突变。在这些SNPs中,C2218G位点处存在苏氨酸和丝氨酸的错义突变,具有CC/CG/GG三种基因型,将该位点基因型与生长相关性状进行关联分析,目前结果初步表明该位点可能与生长相关,此后将开展进一步的研究进行相关验证。
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