粪肠球菌SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR检测方法的建立与应用

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粪肠球菌是人和动物胃肠道内广泛存在的一种重要的机会致病菌,通常不引起动物发病。但近年来滥用抗生素现象在养禽业十分严重,使得禽类感染粪肠球菌的病例逐年增多,且不同成长阶段的禽类均会感染。为了建立一种快速、特异、敏感的检测、诊断鸡粪肠球菌的方法,以对粪肠球菌感染的防治提供便捷的方法,本研究参照Gen Bank中已发表的鸡粪肠球菌全基因组,采用Primer Express5.0软件设计了一对特异引物,先通过常规的普通PCR检测引物的特异性,然后进行敏感性、特异性、重复性试验成功建立了检测鸡粪肠球菌的SYBR Green Ⅰ LC-PCR检测方法,并通过临床组织样品检测评价其临床实用性。结果显示所建立的SYBR Green Ⅰ LC-PCR检测方法标准曲线线性关系良好,相关系数R~2=0.955;在敏感性实验结果中,对粪肠球菌可检测的最低浓度可达10~1 CFU/m L,而常规PCR只能检出10~3 CFU/m L,敏感性高于常规PCR约100倍;在特异性实验结果中,不与屎肠球菌、小肠肠球菌、金黄色葡萄球菌、奇异变形杆菌、沙门氏菌、绿脓杆菌、大肠杆菌等禽源致病原发生交叉反应;重复性试验结果中,同一个浓度,4个平行定量PCR扩增曲线走向基本一致,变异系数小于2%,说明该定量PCR方法重复性好,比较稳定。从患禽采集的肝脏和肾脏样本的DNA作为模板,经SYBR Green Ⅰ LC-PCR方法进行检测,结果均出现了特异性扩增曲线。此检测结果表明该方法对粪肠球菌病临床样本的检测具有很好的特异性和敏感性,并且操作简单便捷、节省时间,可应用于鸡粪肠球菌的日常检测和早期临床诊断。
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