中国科学院上海巴斯德研究所由中国科学院、上海市政府和法国巴斯德研究所三方合作建设，定位与目标是揭示重大传染病病原体持续感染致病机制、免疫保护机制与免疫病理机制，突破免疫治疗的共性技术瓶颈问题，形成重大传染病的诊断、预防、治疗解决方案。依托巴斯德国际网络，服务于国家、区域、全球传染病防控需求，建成传染病防控领域中特色鲜明的标杆式国际化研究所。上海巴斯德研究所公共技术服务中心下辖5个平台。分子影像技术平台提供通用设备、电镜分析、病理及图像分析等技术服务；流式细胞技术平台提供流式技术及应用服务；生物信息学技术平台提供信息服务工具和平台，培训并组建一支多学科生物信息学团队；SPF动物房设施提供良好实验动物管理服务及专业化的技术支持；生物安全实验室设施建筑面积1200平方米，基础设施完善，仪器设备先进，核心实验区设有BSL-2实验操作间12个、ABSL-2饲养操作间5个及生物样本集中保藏室1个。为研究所承担国内外重大科研项目、维护公共卫生安全、应对新发突发传染病等发挥关键作用。公共技术服务中心现有21人。其中技术支撑人员18人，高级职称7人，中级职称4人，初级职称7人，本科以上学历占83％，整个支撑队伍层次结构合理，专业技术水平较高，人员相对稳定。公共技术服务中心拥有仪器设备831台件(含修购专项)，价值6463万元。