生物文献的本体建模及其在语义查询中的应用

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由于现代生物技术的迅速崛起,大大加快了人们对基因组学,蛋白质组学等相关研究工作的步伐,使得与此相关的文献数量呈"爆炸式"增长.从海量生物文献中快速、准确地获取知的需求变得空前迫切.本文充分利用生物文献的结构化信息,对其进行本体建模.将22,997个生物学相关概念组织在一个上下位关系的层次结构中;从结构化的生物义献中抽象出研究人员、研究机构、基金等概念,并细致设计了上述概念的属性,及其之间的关系.我们将生物义献库MEDLINE中的文献作为实例导入到上述本体中,通过三个用例说明我们的本体在扩展生物领域词汇、查询关联复杂实体、跟踪生物领域发展状况等语义查询中的贡献.
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