【摘 要】
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膜型1基质金属蛋白酶(Menbrane-type 1 Matrix metalloproteinases,MT1-MMP,MMP14)作为蛋白水解酶在肿瘤的发生、发展、浸润及转移等过程发挥关键性作用,因此寻找其抑制剂或
【出 处】
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中国遗传学会第九次全国会员代表大会暨学术研讨会
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膜型1基质金属蛋白酶(Menbrane-type 1 Matrix metalloproteinases,MT1-MMP,MMP14)作为蛋白水解酶在肿瘤的发生、发展、浸润及转移等过程发挥关键性作用,因此寻找其抑制剂或者亲和肽有望为肿瘤治疗带来新希望.本研究主要运用反义肽理论及计算机辅助药物设计原理进行靶向MT1-MMP结合肽的筛选,目的:获得高亲和力的靶向MT1-MMP的结合肽,为靶向MT1-MMP的小分子多肽药物研发提供前期工作基础与依据.方法与结果:首先运用Clustal X等生物信息分析软件对人源MMPs家族成员进行多重序列比对,确定MT1-MMP特异序列AYIREGHE(该序列也被称为MT loop)为反义肽目标筛选区域.根据Meker-Idlis(M-I)理论,共设计了1536条8肤反义肽,并用Discovery Studio软件进行短肽三维结构的建模及其优化。采用LibDock进行第一轮虚拟筛选，获得LibDockScore高于200的反义肽96条，然后将其进行Molegro Virtual Docker(MVD)第二轮筛选，获得对接得分较好的5条反义肽FVTFPYIR, LVSFPYVR,FVTFSYVG,FMAFSYVS和FVTLPYVR,其RerankScore值分别为-102.39KJ/moL、-99.64KJ/moL、-97.6847KJ/moL,-97.3496KJ/moL,-95.9034KJ/moL,其中前三条序列均能很好地作用于位于目标区域的Arg168,Glu169,His171等氨基酸组成的活性位点.结论:获得5条与MT1-MMP14的MT loop区对接良好的靶向反义肽。
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