【摘 要】
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用套式PCR检测结合鸡胚分离鉴定方法,从发生呼吸道疾病的猪场分离到一株病毒A/Swine/Zhejiang/1/2007(SW/ZJ/1/2007)。对其基因组序列分析,发现SW/ZJ/1/2007与禽源H1N1 SIV的
【机 构】
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上海市农业科学院畜牧兽医研究所上海市农业遗传育种重点实验室;
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用套式PCR检测结合鸡胚分离鉴定方法,从发生呼吸道疾病的猪场分离到一株病毒A/Swine/Zhejiang/1/2007(SW/ZJ/1/2007)。对其基因组序列分析,发现SW/ZJ/1/2007与禽源H1N1 SIV的基因同源性最高,PB2、PB1、PA、HA、NP、NA、M和NS的核苷酸相似性为分别为96%、97%、97%、95%、97%、96%、98%和98%。与6株禽源H1N1亚型猪流感病毒的氨基酸相似性为91.3-96.5%;与禽流感病毒Duck/Bavaria/1/77相似性为88.3%。SW/ZJ/1/2007 HA1氨基酸序列与A/swine/Cotesd’Armor/1488/99(H1N1)相似性最高达96.5%,有14个氨基酸的差异,其中2个位于抗原位点Ca上。HA1 6个受体结合位点相对保守,只有134和222位存在变异。NA基因与A/swine/Cotesd’Armor/1488/99(H1N1)相似性最高,达96%,氨基酸序列与A/swine/Spain/50047/2003(H1N1)相似性最高,达95%,与2009年流行的甲型H1N1人流感病毒MCalifornia/04/2009相似性92.3%。决定NA蛋白酶活性的16个氨基酸相对保守。遗传进化分析表明:SW/ZJ/1/2007与流行于欧洲的禽源H1N1 SIV属于同一亚系,这是我国首次报道分离到欧洲禽源SIV,提示我国猪流感病毒流行情况较为复杂。
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