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通过对马氏珠母贝不同选育系列第二代幼虫的生长与未经选育的对照组比较发现，选择对种群内自繁系列(BB2、DD2和SS2)幼虫生长有副作用，BB2、DD2和SS2幼虫的生长明显地低于对照SC1；因此，为减少这种副作用的不利影响，在混合选育中需要在每一代选留一定的亲本数量，保证有效的繁殖群体，以避免严重的近亲繁殖造成的近交衰退。选择对种群问杂交系列(BD2、BS2、和DS2)影响分为两种情况；对BS2幼虫的生长有副作用，而对BD2、和DS2幼虫生长无影响，与SC1幼虫的生长速度比较无显著性差异。种群问杂交系列F2的基因分离和重新组合，导致杂交系列对选择的不同反应。利用不同地理种群间杂交育种应采用增殖杂交育种方式，经由一次杂交，从杂种子代优良个体的累代自群交配后代中选育新品种。