农作物病害发生的日趋严重及新病害的不断涌现,全球农用杀菌剂用量呈逐年递增趋势,在农药中的占比逐渐加大.虽然农用杀菌剂的靶标生物是微生物,但是农用杀菌剂对非靶标的肠道微生物菌群的影响及其健康风险的研究少之又少.本研究选取用量大，用途广并具有一个手性中心的甲霜灵为模式化合物，将24只3周龄断奶SD幼鼠分为C组（对照），R组（精甲霜灵，普通甲霜灵的R型异构体）和S组（普通甲霜灵的S型异构体）3组，每组8只，采用低浓度（100 mg/kg）饮食暴露2周后，对幼鼠进行血常规检测发现R组与C组相比，血液指标中与炎症相关的嗜碱细胞和嗜酸细胞数量分别显著上升33%和63%，血清中免疫球蛋白IgE显著上升18%，促炎细胞因子IL-6，IL-ip显著上升了79%和34%，而丫一干扰素则显著下降了28%，显示了幼鼠暴露于R型甲霜灵后感染的风险显著增加。而在对肠道菌群影响的分析中本研究采用16S rRNA基因测序技术分析肠道菌群的组成结构，发现R组中肠道菌群的多样性指数如Shannon和Chaol等均显著下降，在门的水平上发现R组中的Bacteroidetes显著增加，而Actinobacteria和Firmicutes显著减少。通过主成分分析PCA和基于Unifrac的PCoA方法均显示R组肠道菌群与C组对照在种的水平上有着显著差异，其中好胆酸细菌兼性致病菌Alistipes，促炎普氏菌（Prevotella Copri>等类似菌丰度显著增加；而Barnesiella和Bifidobacterium等有益菌则显著减少，从而推断R型异构体精甲霜灵更易导致菌群结构失调，而其中可能致病菌和促炎菌的显著增加和有益菌的减少，肠道菌群的组成变化也显示了幼鼠暴露于R型甲霜灵异构体后炎症性疾病的易感性风险大大增加。本研究从幼鼠的肠道菌群和免疫应答两个方面显示了R型甲霜灵在饮食暴露浓度下显著增加了幼鼠对炎症性疾病的易感风险。本研究首次从对映体层面分析了手性农用抗生素对其非靶标生物肠道菌群和免疫影响的差异，为手性抗生素的毒性甄别提供了理论依据。