CNV不稳定性与较低复制速率的相关性研究

来源 :遗传学与表观遗传学前沿暨第三届中国青年遗传学家论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lcxlllwho
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  DNA复制的准确性对于基因组的完整性至关重要。除了内在的基因组构建和外在环境的诱导因素,DNA复制动态同样与遗传变异相关。最近已有研究表明,复制时相(replication timing)的早晚与人的点突变密切相关,但它与大规模基因组拷贝数变异(large-scale genomic copy number variation,CNV)的相关性并不明显。这可能反映了这两类变异间不同的产生机制。由于CNV基于DNA复制过程的产生机制,如复制叉停滞以及模板转换(fork stalling and template switching),我们假定复制叉行进速率对于CNV变异发生非常重要。文章分析产生了人、小鼠以及果蝇全基因组的复制速率(replication rate)数据,它能潜在反映这些基因组中的复制叉行进速率的特性。有趣的是,文章发现,人与小鼠的生殖细胞CNV断点显著分布于基因组复制速率较慢的区域。这一通过CNV断点将基因组不稳定性与低速率区域关联的现象也被果蝇S2细胞体外证据支持。文章发现S2细胞中体细胞CNV也与低复制速率相关。一致性结果表明较慢的复制叉行进会导致复制错误进而导致CNV的产生。值得注意的是,文章将CNV按断点特性分类分析后,发现同源序列介导产生(homology-mediated)的CNV与低速率区域之间的强相关性,这也与已有的同源序列介导的复制错误的发现一致。减慢的复制速率能反映复制压力以及局部基因组构建对复制叉行进的影响。因此文章表示复制速率可以作为影响CNV变异发生的一个重要DNA复制参数。
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