Notch家族蛋白质Notch1-4和CSL在胰腺癌细胞基因组结合位点的比较分析

来源 :中国生物化学与分子生物学会第十一次会员代表大会暨2014年全国学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wenliang729
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Notch家族是一类高度保守的蛋白,它在器官的发育、细胞的增殖、分化和凋亡都起到至关重要的作用.在哺乳动物中,Notch家族包含有4种受体(Notch 1-4),Notch蛋白没有DNA结合域,需要经过CSL等转录因子发挥转录调节作用.我们的目标是在人胰腺癌细胞系BxPC3细胞中,找出Notch家族和CSL共同作用的转录起始位点和结合位点,明确4个成员的生物学差异.染色质免疫共沉淀联合高通量测序在BxPC3细胞全基因组范围分析Notch家族和CSL共同作用的转录起始位点和结合位点.结果显示在BxPC3细胞中,Notch1、2、3、4和CSL均有不同程度的蛋白表达;Notch和CSL共同的转录因子结合位点在转录起始位点区域的分布主要在1号染色体上,其次为5、1 1、12号染色体上;Notch和CSL共同的转录因子结合位点重合较少,它们所结合的基因位于许多其它相关的通路.在BxPC3的各个染色体上,Notch和CSL的转录因子结合位点并非有广泛的重合.Notch家族与许多的通路有串话,这说明Notch家族在分子水平的调控网络是相当广泛.
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