SVM/MLP方法及基于此的基因选择

来源 :2005中国计算机大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dongrun4696
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本文针对 DNA 微阵列数据的超高维空间和超小样本特性,提出了实现二/多病类样本有效分类的基于SVM/MLP+CV的基因选择方法,该方法运用线性SVM+leave-one-out 解决二病类情况的基因选择问题,并在此基础上运用非线性MLP+leave-one-out解决多病类情况的基因选择问题。对于真实的 DNA 微阵列 MIT 数据(7129 个基因、两个病类、72 个样本的 MIT 数据),用本文方法选择出了 11 个基因,与传统的 SNR 方法表明该方法明显优于传统的 SNR 方法;对于真实的DNA 微阵列 NCI 数据(2308 个基因、64 个样本、4 个病类的 NCI 数据),从 2308 个基因中找出了能对 4 个病类进行有效分类、且具有很好推广能力的 6 个基因,从而利用这些基因既可有效诊断相应疾病,同时又极大降低芯片和诊断费用,表明了本文方法的有效性。
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