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利用ISSR分子标记技术对黄海海区和渤海海区2个不同地区(辽宁丹东，河北秦皇岛)松江鲈(Trachidermus fasciatus)群体的遗传多样性进行分析研究。从77个ISSR引物中筛选出4个引物对松江鲈两个群体48个样品进行扩增，得到44个清晰的扩增位点。松江鲈丹尔和秦皇岛两群体的多念位点比率、Nei’s指数和Shannons指数分别为79．55％、75．00％，0．2750、0．247l，0．4100、0．3725：表明两个群体遗传多样性在同一水平上。基因分化系数Gst、Shannons指数和AMOVA分析均显示松江鲈的遗传变异主要来自于群体内个体间，而群体间无明显的遗传分化。松江鲈UPGMA系统树没有依据群体分别聚类，未出现明显分支，无明显遗传趋异。结果表明，松江鲈丹东和秦皇岛两个群体间无明显的遗传差异，群体间有明显的基因交流，揭示两个地区松江鲈群体亲缘关系很近;两个地区松江鲈群体的遗传多样性处于较低水平，遗传变异相对贫乏。