【摘 要】
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为探索HDAC1基因在文蛤生长发育中的作用,本研究通过已构建的文蛤转录组文库,利用SMART RACE技术扩增得到文蛤HDAC1(Mm-HDAC1)基因的cDNA全长序列,分析了其生物信息学、组织及发育阶段表达特征,并用直接测序法在外显子中筛查生长相关的SNP位点.结果显示,Mm-HDAC1基因的cDNA全长3065bp,开放阅读框1599bp,编码532个氨基酸;氨基酸序列比对发现,文蛤与其他物
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为探索HDAC1基因在文蛤生长发育中的作用,本研究通过已构建的文蛤转录组文库,利用SMART RACE技术扩增得到文蛤HDAC1(Mm-HDAC1)基因的cDNA全长序列,分析了其生物信息学、组织及发育阶段表达特征,并用直接测序法在外显子中筛查生长相关的SNP位点.结果显示,Mm-HDAC1基因的cDNA全长3065bp,开放阅读框1599bp,编码532个氨基酸;氨基酸序列比对发现,文蛤与其他物种同源性为74.3％～78.7％.荧光定量PCR(qRT-PCR)结果表明,Mm-HDAC1基因在文蛤6个组织中均有表达,其中外套膜中的表达量相对最高,并与其他组织间有极显著差异(P＜0.01);不同发育时期的表达差异结果表明,Mm-HDAC1基因在壳顶幼虫期表达量最高,显著高于其他发育时期(P＜0.05).SNP位点筛查结果表明,在Mm-HDAC1基因的外显子区域发现了19个SNP位点,其中有3个SNP位点(627A＞T、924T＞C和1266T＞C)与文蛤生长相关.
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