利用简化基因组技术分析甘薯种间单核苷酸多态性

来源 :江苏省遗传学会2016年学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ulysseschen
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  选用Xushu 18(6x)和Nancy Hall(6x)、2 个二倍体I.trifida(2x)品系(4597-10 和4597-21)、四倍体I.trifida(4x)、六倍体 I.trifida(6x)、二倍体 I.temussima(2x)和I.littorallis(2x)以简化基因组测序技术 SLAF-seq 测序,获得 724 589 个 SLAF 标签,其中多态性 SLAF 标签 35 310 个.通过序列分析,获得 40 765 个有效单核苷酸多态(SNP),并用这些 SNP 分析了 8 个种质的群体结构和系统发生树.结果 表明,利用简化基因组测序技术 SLAF-seq 能高效、低成本地开发出大量可用于群体遗传分析的 SNP 标记; 通过构建进化树发现甘薯栽培种和野生种I.trifida 的亲缘关系比较近.这些分析结果为进一步研究甘薯栽培种的起源提供了基础数据.
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