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目的:克隆人的hole基因,并进行生物信息学分析。
方法:以胚胎心脏cDNA文库为模板,进行PCR扩增得到hole基因的ORF。并进行亚克隆入PMD18-T 载体,转化大肠杆菌DH5α,用Xho1进行酶切和测序鉴定阳性克隆。利用Internet和GeneBank数据库对测序结果正确的hole基因进行生物信息学分析。
结果:克隆了hole基因,测序结果正确;生物信息学分析表明,hole基因开放读码为960bp,编码319个氨基酸;同源性分析表明,人的hole与鼠、鸡hole蛋白具有高度同源性。多种组织的半定量RT-PCR研究表明,该基因在心脏、肝脏、肺、脑、肾脏、脾脏、胰脏均有表达,其心脏表达最高。
结论:成功克隆hole基因,对其功能进行了初步预测,为进一步的功能研究打下基础。