【摘 要】
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目的：探讨从巨量微阵列基因数据中提取有效信息的方法。
方法：以人肿瘤cDNA微阵列1.2分析并获得间变性星形细胞瘤和正常脑组织的差异表达基因数据,进行CityBlock距离和平均
【机 构】
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解放军254医院神经外科,天津300142天津医科大学总医院神经外科,天津300000哈尔滨医科大学生物信息学研究室,哈尔滨,150086
【出 处】
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2003年中国博士后生命科学学术研讨会暨院士论坛
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目的：探讨从巨量微阵列基因数据中提取有效信息的方法。
方法：以人肿瘤cDNA微阵列1.2分析并获得间变性星形细胞瘤和正常脑组织的差异表达基因数据,进行CityBlock距离和平均距离法的聚类分析,然后将所获得的各类基因信息以超几何分布计算概率法链接到GO数据库中,以基因通路方式对这些基因在GO数据库中的差异显著程度进行评价。
结果：从数以千计的基因数据中获得了121个差异显示基因并分成6类,这6类基因的生物学功能基本与该肿瘤的生物学特点符合。链接到GO数据库中后,提示Rho蛋白信号转导、蛋白区域特异结合基因、磷脂酶抑制子、Rho小单体GTP酶、3磷酸肌醇依赖蛋白激酶和一组分子功能未知基因等6个基因通路差异表达最显著。
结论：应用生物信息学方法对微阵列研究获得的基因信息进行进一步分析,有利于提取巨量基因数据中的有效信息。
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