本文以A市铁路客运专线（T县段）建设项目土地房屋征收和Y县店前滨河新区店前综合治理项目征收为案例,对集体土地上房屋征收估价方法进行对比分析,旨在为集体土地上房屋征收估价工作方法选取提供依据。本文研究结果表明,集体土地上房屋征收估价工作通常采用比较法、收益法和成本法。然而集体土地上的房屋较国有土地上房屋而言可选择可比实例少,市场的情况不够清晰,很难去运用市场法来估价。在运用收益法时,难以确定的相关参数致使该估价方法在运用时会受到一定的限制。所以常见的三种估价方法在市场法和收益法都不适用的情况下,大多集体土地上房屋征收估价工作只能去选择成本法,虽然该方法能够比较充分地考虑到资产的各种损耗,看似公平合理,但是运用该方法却无法把握房屋价值市场价进而响结果的准确性。鉴于如上结果,要灵活选取运用估价方法,根据集体土地上房屋具体情况来判断选取何种方法。我们可以采用多种交叉验证的方法得到最合理的估价结果。