【摘 要】
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干酪乳杆菌(Lactobacillus casei LC2W)作为一种重要的益生菌运用于乳制品和制药工业.通过对L.casei LC2W全基因组序列进行RAST注释继而运用Model SEED自动化构建L.casei
【机 构】
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食品科学与技术国家重点实验室,无锡,214122
【出 处】
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第五届全国微生物基因组学及合成生物学学术研讨会暨陈华葵先生100周年纪念大会
论文部分内容阅读
干酪乳杆菌(Lactobacillus casei LC2W)作为一种重要的益生菌运用于乳制品和制药工业.通过对L.casei LC2W全基因组序列进行RAST注释继而运用Model SEED自动化构建L.casei初模型,结合手动注释和文献信息,获得首个基因组规模代谢网络模型,该模型包含846个基因、970个反应、785个代谢物.该模型成功验证了细胞在25种碳源生长表型.L.casei LC2W全基因中342个基因的功能被重新注释.运用该模型,10种氨基酸和7种维生素被鉴定为L.casei必需生长元素.同时,该模型为L.casei LC2W发酵生产乳酸、乙偶姻、双乙酰、胞外多糖提供高效的指导,包括乳酸的生产对氨基酸的需求分析；氧气对风味化合物生产的影响；乙偶姻增产的三个新敲除靶点；影响胞外多糖生产的11种营养元素和重要反应等.总而言之,该模型为探究L.casei的生理特征提供了高效、系统的平台.
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