甜瓜是热带和亚热带地区广泛种植的重要园艺水果作物,作为甜瓜生产和消费大国,我国甜瓜种植总面积大约为40万公顷。作为甜瓜生产上的重要病害,甜瓜枯萎病常导致甜瓜植株死亡,严重影响其产量和品质,其病原菌为尖孢镰刀菌甜瓜专化型(Fusarium oxysporum f.sp.melonis)。世界范围内已在镰刀菌中检测到多种真菌病毒,其中大多数真菌病毒(已报道全基因组序列)主要来源于禾谷镰刀菌(F.graminearum)。本研究以从甜瓜枯萎病病害样品中分离鉴定得到的135株尖孢镰刀菌甜瓜专化型为对象,利用高通量测序分析其中真菌病毒的种类,以期探索其生防潜力,为防治甜瓜枯萎病提供生防资源。高通量测序数据处理得到61个病毒相关Contigs,这些信息涵盖了8个不同的科以及一些未明确分类的病毒。按照病毒核酸类型,这61个病毒序列包括39个正单链RNA病毒(占64%)、10个双链RNA病毒(占16%)、7个未分类的病毒(12%)、3个未分类RNA病毒(5%)以及2个双链DNA病毒(3%)。其中,正单链RNA病毒主要分布在马铃薯Y病毒科(41%)(主要为甘蔗花叶病毒,SCMV)中,这是首次在尖孢镰刀菌甜瓜专化型中检测到疑似跨界侵染的甘蔗花叶病毒。