到了宋元时期符咒已不单纯是与神交感的巫术或法术，重视的是持法者自身精气神的修持境界，着重在静坐、存想、炼神、还虚等工夫的锻炼，开发自己的生命境界来参与天地气动的造化，冀求不仅能发动雷机与左右风雨，还能在施法中展现出人神合一的变神能力，将自我的生命提升到相应于神真的超越存在，此时人即是神，象征着宇宙至尊在人间的显现，能惊动天地来代天行道。《道法会元》承续了先秦到宋代理学的宇宙论，追究宇宙的本原与生命的本原，深化了宇宙道化与气化的生成法则，运用在符咒的感通体验上，不只强调人与鬼神互为一体，更重视人与天地混然一体的生命能量。宋代自周敦颐的《太极图说》起，大多集中于无极而太极的哲学论辩，重视无极与太极的生化作用，以此来推演宇宙的产生与发展的过程，此时道教的符咒法术也受到此等学术思潮的影响，相当重视自身宇宙论的建构，双方虽然在论题上颇为相近，但是基于宗教的通神需求，道教对宇宙的运作与生成法则，有自己一套独特的宇宙本体论与生命论。