茶尺蠖蜕皮激素受体EcR基因的克隆、生物信息学和表达分析

来源 :福建省科协第十五届学术年会农业分会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:HOHOHO66
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目的:蜕皮激素受体(ecdysteroid receptor,EcR)是一种超家族核受体,它能与超气门蛋白USP组成异源二聚体复合物EcR/USP,调节20-羟基蜕皮酮(20E)的生物活性,进而调控昆虫的发育、变态及繁殖等生命过程.本研究旨在克隆荼尺蠖Ectropis oblique(Prout)EcR(Eo-EcR)的基因全长,并了解该基因的编码蛋白特征和时空表达模式,为阐明Eo-EcR的分子功能和基于Eo-EcR为靶标杀虫剂研制莫定基础. 方法:通过RT-PCR方法并结合RACE技术,克隆茶尺蠖EcR的基因全长,通过生物信息学软件和在线网站分析荼尺蠖EcR的生物学特性,通过实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR,qRT-PCR)技术比较茶尺蠖EcR在不同发育时期和不同组织中的相对表达含量. 结果:克隆并鉴定了一个茶尺蠖EcR基因(基因登入号为:KP869130.1),Eo-EcR全长2268bp,含有1728bp开放阅读框,能编码576个氨基酸.系统进化树和氨基酸同源性比对表明,Eo-EcR具有相对保守的进化特性,特别是与鳞翅目昆虫的保守性最高.三级结构模拟和功能结构域预测表明,Eo-EcR具有3个经典的结构模型并以α螺旋为主,功能位点单一且为C4型锌指结构.qRT-PCR结果表明,Eo-EcR在5龄、6龄幼虫和成虫期表达量较高,在其他龄期表达量变化不大.同时在前胸腺表达量最高,在血淋巴表达量最低. 结论:明确了Eo-EcR的核苷酸序列及编码蛋白特征,明确了Eo-EcR的时空表达特性.该研究结果为进一步研究Eo-EcR的分子功能和基于Eo-EcR为靶标杀虫剂研制莫定分子基础.
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