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系统研究了滇东地区4个晚志留世至中泥盆世地质剖面的孢粉生物地层,鉴定并描述小孢子化石52属194种(含14新种,39个未定种),鉴定出疑源类化石14属15种,隐孢子化石9属11种,及植物碎片化石13种类型(含7种未定类型)。根据部分孢子化石的首现将滇东孢子化石组合分为7个孢子组合带,自下而上依次为Ambitisporites dilutus-Apiculiretusispora synorea(DS)组合带、Synorisporites verrucatus-Apiculiretusispora plicata(VP)组合带、Apiculiretusispora minuta-Leiotriletes ornatus(MO)组合带、Verrucosisporites polygonalis-Dibolisporites wetteldorfensis(PW)组合带、Archaeoperisaccus indistinctus-Cristatisporites orcadensis(IO)组合带、Geminospora lemurata-Cymbosporites magnificus(LM)组合带和Cyrtospora cristifer-Cristatisporites triangulatus(CT)组合带。DT组合带的时代为Ludfordian晚期至Pridoli最早期,VP组合带的时代为早Pridoli世至Lochkovian最早期,MO组合带的时代为Lochkovian早期至晚期,PW组合带的时代为Pragian期,IO组合带的时代为Eifelian晚期至Givetian早期,LM组合带的时代为Givetian中期,LM组合带的时代为Givetian晚期。通过系统研究玉龙寺组上段至西冲组的孢子组合,结合本文研究的疑源类化石及其他门类化石研究的成果,认为志留/泥盆系界线位于西屯组中段内部,滇东地区缺失Emsian期的绝大部分地层,早泥盆统/中泥盆统界线可能在本地区并不存在。