本文综述了课题组在药用植物内生真菌研究和应用方面取得的进展。近十年来，课题组从中国近500种珍稀濒危药用植物/真菌中分离内生真菌12000余株。用于分离真菌的材料主要来源于：①各种生态类型的兰科植物；②分布于特殊或极端环境的药用植物，包括分布于高海拔、热带雨林、海洋潮间带等的药用植物；③药用真菌，如猪苓、冬虫夏草等。通过研究内生真菌与宿主植物的相互作用，发现35株真菌可以促进天麻、铁皮石斛、金线莲、天山雪莲等药用植物的生长发育，提高栽培植株的抗病性，提高植物体内有效成分的含量。这些活性菌株在铁皮石解等濒危药用植物的资源保护、再生、合理利用等方面具有良好的应用前景。内生真菌发酵产物活性筛选的研究己经发现：近300株真菌具有抗病原微生物活性、77株真菌具有抗HIV-1病毒活性、103株真菌具有抑制肿瘤细胞活性。对12株具有生物活性的内生真菌进行了次生代谢产物研究，共鉴定200个次生代谢产物的化学结构，其中新化合物33个。体外筛选研究共发现11个单体化合物有确切作用，且活性强度高，具有开发前景，目前正在从菌种选育、发酵条件优化、富集及纯化方法、药效学及毒理学研究等方面对它们开展深入的研究。上述工作为阐明药用植物的道地性、为利用内生真菌提高植物药材的产量和质量、以及从多样性丰富的内生真菌中开发新药具有重要意义。