基于16SrRNA部分序列探讨中国近海十三种石首鱼类的分子系统进化关系

来源 :2009年中国水产学会学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sunny_cui
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  为进一步探讨中国近海石首鱼类的系统进化关系,通过PCR扩增获得了石首鱼科9属13个种的线粒体1 6 S rRNA基因片段序列,纯化后直接测序,以大斑石鲈(Pomadasys maculatus)为外群,利用MEGA4.1,DnaSpv5软件对序列变异和碱基组成进行分析,计算遗传距离,平均核苷酸变异度数等遗传信息指数,并结合GENEBANK上浅色黄姑鱼(Nibea coibor)和云纹犬牙石首鱼(Cynoscion nebulosus)构建系统树.根据所得分子生物学数据并结合已知形态学理论,得出如下结果:1)叫姑鱼亚科是最早独立分化出来的一支;银牙(鱼或)(Otolithes argenteus)是继叫姑鱼亚科后较早分化的一支;黄鱼亚科为最后分化并成为石首鱼类中最繁盛的一个亚科;勒氏石首鱼(石首鱼亚科)除了与大黄鱼小黄鱼遗传距离很远(0.170,0.172)外,与其它亚科的种遗传距离集中在0.128到0.164.这支持形态学上将其作为系统树根部的处理;2)银姑鱼(Pennahia argentatus)与分子树最上端的黄鱼亚科聚在一起,并且处在该大支的最下端,且银姑鱼与小黄鱼大黄鱼 鮸鱼棘头梅童鱼之间的遗传距离分别为0.099,0.106,0.0900.090;说明银姑鱼是白姑鱼亚科分化最晚的一种;而白姑鱼亚科的其它种属位置比较游离,需要进一步考证;.3)牙(鱼或)亚科的银牙(鱼或)是属继叫姑鱼之后较早分化的一个种,但是尖头黄鳍牙(鱼或)不与银牙(鱼或)聚类,需要别的基因进行进一步考证.
其他文献
本文研究了TTSuV和TTSuVs从母猪到胎儿的传播途径。分别将6头母猪与13头公猪混在一起的,一组采用TTSuVs阴性的精液人工授精,另一组采用TTSuVs阳性的精液人工授精,采集分娩前9天母猪血样,新生仔猪在出生后(吃初乳前)马上采集血清用套式PCR检测检测TTSuVl和TTSuV2。实验结果表明,大多数新生仔猪都检测到与母猪相应的TTSuVs,病毒可以通过精液引起子宫内感染。
目的:调查外周血单核细胞中TTSuVs(TTSuV1和TTSuV2)的含量及其感染动态,并与血清中TTSuVs相比较。方法:以8头母猪及其所产的24只仔猪为研究对象。从前腔静脉采集血样。血样1800×g离心20min收集血清,采用Ficoll-Conrey梯度溶液方法从加肝素的血样中获取外周血单核细胞。同一头母猪所产3只仔猪血清混在一起作为一个样,和外周血单核细胞混在一起作为一个样,进行DNA测序
本文从猪血清中提取出了一种新的TTSuV3,通过对其DNA测序,并与Genbank里的序列比对,得出了其分子结构;然后采用实时定量PCR检测方法,分析了流行状况。
本文从巴西南部、东南部和中西部区域采集了135份1到3周龄哺乳仔猪的粪便样品,用PCR方法检测TTSuV1和TTSuV2。检测结果表明:TTSuV1和TTSuV2在1、2、3周龄仔猪的检出率分别为42.8%和14.3%、47.7%和20.4%、53%和16.3%。
本文运用多种方法调查了德国南部多点体系的猪肺炎支原体感染动力学。方法:以接种Stellamune One疫苗的猪为研究对象,采集猪肺尖叶运用组织病理学、免疫组织化学和PCR进行检测。检测结果表明,感染发生在育肥期,可能与疫苗免疫有关。
目的:测定猪肺炎支原体对氟苯尼考的最小抑菌浓度(MICs)。方法:从有呼吸道疾病仔猪的呼吸道分离95株猪肺炎支原体。在含有酚红的Friis液体培养基中,使用微量稀释法测定氟苯尼考的MICs。并以猪肺炎支原体ATCC 25934(J株)作为对照。结果:氟苯尼考抑制猪肺炎支原体的MICs在O.O6g/ml至1g/ml的范围内,其MIC50为0.25g/mL,MIC90为O.5g/mL。结论:氟苯尼考具
美洲鲥(Alosa sapidissima)受精卵球形、无油球,为沉性卵,卵径3.75 mm~4.06mm.在水温20.3-21.9℃孵化条件下,美洲鲥初孵仔鱼全长为8.61±0.50mm,其卵黄囊体积为4.59±0.93mm3.1日龄仔鱼脑部开始发育,口张开,肛门开通,胸鳍形成.2日龄仔鱼卵黄囊体积0.74±0.19mm3,只有刚孵化的16%.3日龄仔鱼经过1d的混合营养期,卵黄被完全吸收,4日
本文以曼氏无针乌贼为特色品种,结合头足类其他三个种(长蛸、短蛸、真蛸),以其血液为研究对象,通过光镜电镜手段对血液中的血细胞形态结构进行详细的观察比较,然后加以较为系统的分类。血细胞分类主要依据细胞内颗粒的有无,颗粒的大小和密度,以及核质比等标准,在综合光镜和电镜观察结果后,将头足类血细胞分成三种类型:透明细胞,小颗粒细胞及颗粒细胞,但在真蛸血细胞中又见有一定数量的血细胞细胞核呈马蹄形,因此将此类
日本鳗鲡(Anguilla japonica)是亚洲具有重要经济价值的降河洄游鱼类,长江口是我国仅存的成鳗渔业水域.为了解长江口降海洄游鳗鲡的年龄生长及迁移行为,于2008年9-11月在江苏靖江段(31 °30′N,120°42′E)采集了153尾银色鲡样本,以矢耳石为材料,分析年龄结构与生长特征,利用质子激发荧光分析方法(Proton Induced X Ray Emission,简称PIXE)
胃质子泵,又名胃H+/K+-ATP酶,是胃酸分泌的关键性酶.胃质子泵由α、β亚基组成,α亚基负责催化和转运H+、K+,β亚基起稳定α亚基和辅助泌酸的作用.本研究利用RACE-PCR技术克隆了鳜(Siniperca chuatsi)胃质子泵α、β亚基的全长cDNA序列.α亚基全长3581bp,包括178bp的5,端非翻译区(UTR)和334bp的3,UTR,3069bp的开放阅读框(ORF)共编码1